随着农民生活水平不断提高，农村的生活垃圾不仅有腐烂的秸秆、菜叶、瓜果皮，还有塑料袋、废旧电池、农药瓶等，垃圾中难降解的有机物迅速增加。环境检测机构发现这些都是造成农村水污染的成因，具体如下：
1、生活污染
目前，农村并没有广泛地建立垃圾清运处理系统，这些垃圾不能及时回收和有效处理，任其在自然条件下分化和分解，因此，产生的大量酸性和碱性有机污染物及重金属造成地表水和地下水的严重污染。废水检测发现在广大的农村地区，居民居住分散，不可能对生活污水进行统一处理，因此，大量生活污水直接排入田间、河流或者湖泊，对农村水环境产生了十分严重的污染。
生活废水检测
2、乡镇企业污染
乡镇企业在农村经济的发展过程中扮演着重要的角色，为农村提供更多的就业机会和财政收入，改善农民的生活条件。但是，由于多数乡镇企业追求效益优先，以及乡镇企业本身条件的限制，生产设备陈旧、生产技术落后以及粗放的生产模式是乡镇企业普遍存在的现象。并且，由于多数乡镇企业布局为紧靠河流或者与农田、农村居民点交织在一起，因此对农田以及农村水体造成了更大程度的污染。特别是，小型纸厂以及化工企业对广大农村水域的污染十分突出。
乡镇污水检测
3、规模化畜禽养殖污染
规模化畜禽养殖的发展，在推动农业发展、促进农民增收等方面功不可没。但是，农村畜禽养殖多为无序分散状况，而且数量较多。在人口密集的集约化养殖场，其规模和布局没有得到有效控制，没有注意避开人口聚集区，危害直接。相关数据显示，90%规模化养殖场没有经过环境影响评价，60%养殖场缺乏必要的污染防治措施，既没有防渗型水泥池贮存粪尿，也没有相应面积的农田就地消纳，畜禽粪便的还田率只有30%～50%。因此，大量的畜禽粪便、废弃物和废水就直接排放到附近的水体中，严重污染河流和水库，使河道水体变黑、富营养化，导致水藻营养过剩，水体缺氧，水中鱼虾死亡，使人畜共患疾病的发病率提高。
畜禽养殖污水检测
4、化肥、农药等农业面源污染
近年来，农民为追求农业经济利益，化肥施用量过大，施肥结构不合理，施肥方法不当和施用高毒性、持久性农药的现象比较普遍。目前，中国农业每年的化肥使用量己经超过4000万吨，而利用率却只有30%～40%。单位农田使用的农药比发达国家多出30%～50%，其中10%～20%附在植物体上。而残余的化肥和农药则通过农田排灌水及地表径流等方式进入地表水体，引起地表水体的富营养化，进而渗入到地下，使地下水的总矿化度、总硬度、硝酸盐、亚硝酸盐、氯化物和重金属含量逐渐升高，废水检测发现这些已经严重污染地下水的水质，被有机化学药品污染的水难以净化，威胁人类饮用水的安全。
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